Полногеномные исследования миомы матки

DOI

https://dx.doi.org/10.18565/aig.2023.156

Алали О.М., Чурносов М.И.
ФГАОУ ВО «Белгородский государственный национальный исследовательский университет», Белгород, Россия

Цель: Проведение анализа опубликованных полногеномных исследований миомы матки (ММ) с целью выявления значимых полногеномных анализов ассоциаций (ПГАА) полиморфных локусов, связанных с ММ.
Материалы и методы: Поиск публикаций осуществлялся в электронных базах данных PubMed, PubMed Central, eLibrary и в каталоге GWAS (ПГАА) за период с 2011 г. по настоящее время. Для поиска использовались следующие ключевые слова: «uterine leiomyomas», «fibroids», «GWAS studies», «candidate genes».
Результаты: В обзоре описаны результаты восьми полногеномных исследований ММ, в которых было выявлено 34 ПГАА-значимых полиморфных локуса, связанных с происхождением и прогрессированием этого заболевания. Однако результаты немногочисленных репликативных исследований ПГАА оказались неоднозначными. В опубликованных исследованиях ПГАА ММ и некоторых распространенных однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), связанных с риском развития ММ, удалось реплицировать некоторые гены и их близлежащие участки. Однако следует отметить, что 15 из 34 известных на сегодняшний день ПГАА-значимых генов показали ассоциацию с заболеванием только в одном ПГАА, и требуются дальнейшие репликативные исследования для подтверждения их роли в возникновении болезни. Секвенирование экзонов позволило выявить участие ряда генов, таких как MED12 и других, в формировании ММ, что значительно расширяет наше представление о генетических факторах, влияющих на это заболевание.
Заключение: В обзоре были рассмотрены основные полногеномные исследования ММ, выявлены ПГАА-значимые полиморфизмы, ассоциированные с ММ. Полученные данные о ПГАА-значимых локусах могут быть использованы как для отбора полиморфизмов в репликативных исследованиях ММ в различных популяциях, так и для расширения наших представлений о молекулярно-генетических механизмах развития этого заболевания. Секвенирование экзонов существенно способствует более глубокому пониманию генетических факторов, определяющих развитие ММ.

Вклад авторов: Алали О.М., Чурносов М.И. – концепция и дизайн исследования; Алали О.М. – сбор и обработка материала, написание текста; Чурносов М.И. – редактирование.
Конфликт интересов: Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Финансирование: Работа выполнена без спонсорской поддержки.
Для цитирования: Алали О.М., Чурносов М.И.
Полногеномные исследования миомы матки.
Акушерство и гинекология. 2023; 7: 28-38
https://dx.doi.org/10.18565/aig.2023.156

миома матки

полиморфизмы

полногеномный анализ ассоциаций (ПГАА)

ассоциация

секвенирование экзонов

гены-кандидаты

репликативные исследования

Полный текст статьи
доступен в "Библиотеке Врача"

Donnez J., Dolmans M.M. Uterine fibroid management: from the present to the future. Hum. Reprod. Update. 2016; 22(6): 665-86. https://dx.doi.org/10.1093/humupd/dmw023.
Drayer S.M., Catherino W.H. Prevalence, morbidity, and current medical management of uterine leiomyomas. Int. J. Gynecol. Obstet. 2015; 131(2): 117-22. https://dx.doi.org/10.1016/j.ijgo.2015.04.051.
Bulun S.E. Uterine fibroids. N. Engl. J. Med. 2013; 369(14): 1344-55.https://dx.doi.org/10.1056/NEJMra1209993.
Ponomarenko I., Reshetnikov E., Polonikov A., Verzilina I., Sorokina I., Yermachenko A. et al. Candidate genes for age at menarche are associated with uterine leiomyoma. Front. Genet. 2021; 11: 512940.https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2020.512940. 11:512940.
Doherty L., Mutlu L., Sinclair D., Taylor H. Uterine fibroids: clinical manifestations and contemporary management. Reprod. Sci. 2014; 21(9):1067-92. https://dx.doi.org/10.1177/1933719114533728.
Министерство здравоохранения Российской Федерации. Миома матки. Клинические рекомендации. 2020.
Alali O.M., Churnosov M.I. The etiopathogenesis of uterine leiomyomas: a review. Gynecology. 2023; 25(1): 22-30. https://dx.doi.org/10.26442/20795696.2023.1.201827.
Van Heertum K., Barmat L. Uterine fibroids associated with infertility. Women’s Health. 2014; 10(6): 645-53. https://dx.doi.org/10.2217/WHE.14.27.
Wise L.A., Laughlin-Tommaso S.K. Epidemiology of uterine fibroids–from menarche to menopause. Clin. Obstet. Gynecol. 2016; 59(1): 2-24.https://dx.doi.org/10.1097/GRF.0000000000000164.
Адамян Л.В., ред. Миома матки: диагностика, лечение и реабилитация. Клинические рекомендации по ведению больных. М.: Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академикаВ.И. Кулакова; 2015. 100с.
Alsudairi H.N., Alrasheed A.T., Dvornyk V. Estrogens and uterine fibroids: an integrated view. Res. Results Biomed. 2021; 7(2): 156-63.https://dx.doi.org/10.18413/2658-6533-2021-7-2-0-6.
Al-Hendy A., Myers E.R., Stewart E. Uterine fibroids: burden and unmet medical need. Semin. Reprod. Med. 2017; 35(6): 473-80.https://dx.doi.org/10.1055/s-0037-1607264.
Pavone D., Clemenza S., Sorbi F., Fambrini M., Petraglia F. Epidemiology and risk factors of uterine fibroids. Best Pract. Res. Clin. Obstet. Gynaecol. 2018; 46: 3-11. https://dx.doi.org/10.1016/j.bpobgyn.2017.09.004.
Ciebiera M., Włodarczyk M., Słabuszewska-Jóźwiak A., Nowicka G., Jakiel G. Influence of vitamin D and transforming growth factor β3 serum concentrations, obesity, and family history on the risk for uterine fibroids. Fertil. Steril. 2016; 106(7): 1787-92. https://dx.doi.org/10.1016/j.fertnstert.2016.09.007.
Пономаренко И.В., Чурносов М.И. Современные представления об этиопатогенезе и факторах риска лейомиомы матки. Акушерство и гинекология. 2018; 8: 27-32.
Qin H., Lin Z., Vásquez E., Xu L. The association between chronic psychological stress and uterine fibroids risk: a meta‐analysis of observational studies. Stress Health. 2019; 35(5): 585-94. https://dx.doi.org/10.1002/smi.2895.
Пономаренко И.В., Полоников А.В., Чурносов М.И. Полиморфные локусы гена LHCGR ассоциированы с развитием миомы матки. Акушерство и гинекология. 2018; 10: 86-91.
Meadows K.L., Andrews D.M., Xu Z., Carswell G.K., Laughlin S.K., Baird D.D., Taylor J.A. Genome-wide analysis of loss of heterozygosity and copy number amplification in uterine leiomyomas using the 100K single nucleotide polymorphism array. Exp. Mol. Pathol. 2011; 91(1): 434-9.https://dx.doi.org/10.1016/j.yexmp.2011.03.007.
Bondagji N.S., Morad F.A., Al‐Nefaei A.A., Khan I.A., Elango R., Abdullah L.S. et al. Replication of ПГАА loci revealed the moderate effect of TNRC6B locus on susceptibility of Saudi women to develop uterine leiomyomas. J. Obstet. Gynaecol. Res. 2017; 43(2): 330-8. https://dx.doi.org/10.1111/jog.13217.
Nikpey P., Nazari T., Khalili S., Ebrahimi A. The role of epidermal growth factor receptor (EGFR) common gene mutations in Iranian women with uterine fibroids. Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 2018; 229: 103-7.https://dx.doi.org/10.1016/j.ejogrb.2018.08.017.
Zhang K., Winer H., Aissani B. Admixture mapping of genetic variants for uterine fibroids. J. Hum. Genet. 2015; 60(9): 533-8. https://dx.doi.org/10.1038/jhg.2015.60.
Dehghan A. Genome-wide association studies. Methods Mol. Biol. 2018; 1793: 37-49. https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-7868-7_4.
Cha P.C., Takahashi A., Hosono N., Low S.K., Kamatani N., Kubo M., Nakamura Y. A genome-wide association study identifies three loci associated with susceptibility to uterine fibroids. Nat. Genet. 2011; 43(5): 447-50.https://dx.doi.org/10.1038/ng.805.
Hellwege J.N., Jeff J.M., Wise L.A., Gallagher C.S., Wellons M., Hartmann K.E. et al. A multi-stage genome-wide association study of uterine fibroids in African Americans. Hum. Genet. 2017; 136(10): 1363-73. https://dx.doi.org/10.1007/s00439-017-1836-1.
Rafnar T., Gunnarsson B., Stefansson O.A., Sulem P., Ingason A., Frigge M.L. et al. Variants associating with uterine leiomyoma highlight genetic background shared by various cancers and hormone-related traits. Nat. Commun. 2018; 9(1): 1-9. https://dx.doi.org/10.1038/s41467-018-05428-6.
Välimäki N., Kuisma H., Pasanen A., Heikinheimo O., Sjöberg J., Bützow R. et al. Genetic predisposition to uterine leiomyoma is determined by loci for genitourinary development and genome stability. Elife. 2018; 7: e37110.https://dx.doi.org/10.7554/eLife.37110.
Edwards T.L., Giri A., Hellwege J.N., Hartmann K.E., Stewart E.A., Jeff J.M. et al. A trans-ethnic genome-wide association study of uterine fibroids. Front. Genet. 2019; 10: 511. https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2019.00511.
Gallagher C.S., Mäkinen N., Harris H.R., Rahmioglu N., Uimari O., Cook J.P. et al. Genome-wide association and epidemiological analyses reveal common genetic origins between uterine leiomyomata and endometriosis. Nat. Commun. 2019; 10(1): 4857. https://dx.doi.org/10.1038/s41467-019-12536-4.
Masuda T., Low S.K., Akiyama M., Hirata M., Ueda Y., Matsuda K. et al. GWAS of five gynecologic diseases and cross-trait analysis in Japanese. European J. Hum. Genet. 2020; 28(1): 95-107. https://dx.doi.org/10.1038/s41431-019-0495-1.
Sakai K., Tanikawa C., Hirasawa A., Chiyoda T., Yamagami W., Kataoka F. et al. Identification of a novel uterine leiomyoma GWAS locus in a Japanese population. Sci. Rep. 2020; 10(1): 1197. https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-58066-8.
Koltsova A.S., Efimova O.A., Malysheva O.V., Osinovskaya N.S., Liehr T., Al-Rikabi A. et al. Cytogenomic profile of uterine leiomyoma: in vivo vs. in vitro comparison. Biomedicines. 2021; 9(12): 1777. https://dx.doi.org/10.3390/biomedicines9121777.
Mäkinen N., Mehine M., Tolvanen J., Kaasinen E., Li Y., Lehtonen H.J. et al. MED12, the mediator complex subunit 12 gene, is mutated at high frequency in uterine leiomyomas. Science. 2011; 334(6053): 252-5.https://dx.doi.org/10.1126/science.1208930.
Fusco A., Fedele M. Roles of HMGA proteins in cancer. Nat. Rev. Cancer. 2007; 7(12): 899-910. https://dx.doi.org/10.1038/nrc2271.
Baranov V.S., Osinovskaya N.S., Yarmolinskaya M.I. Pathogenomics of uterine fibroids development. Int. J. Mol. Sci. 2019; 20(24): 6151.https://dx.doi.org/10.3390/ijms20246151.
Yatsenko S.A., Mittal P., Wood-Trageser M.A., Jones M.W., Surti U., Edwards R.P. et al. Highly heterogeneous genomic landscape of uterine leiomyomas by whole exome sequencing and genome-wide arrays. Fertil. Steril. 2017; 107(2): 457-66. https://dx.doi.org/10.1016/j.fertnstert.2016.10.035.
Kämpjärvi K., Park M.J., Mehine M., Kim N.H., Clark A.D., Bützow R. et al. Mutations in exon 1 highlight the role of MED 12 in uterine leiomyomas. Hum. Mutat. 2014; 35(9): 1136-41. https://dx.doi.org/10.1002/humu.22612.
Firdaus R., Agrawal P., Anagani M., Vijayalakshmi K., Hasan Q. Multiple mutations in exon-2 of med12 identified in uterine leiomyomata. J. Reprod. Infertil. 2021; 22(3): 201-9. https://dx.doi.org/10.18502/jri.v22i3.6720.
Ajabnoor G.M., Mohammed N.A., Banaganapalli B., Abdullah L.S., Bondagji O.N., Mansouri N. et al. Expanded somatic mutation spectrum of MED12 gene in uterine leiomyomas of Saudi Arabian women. Front. Genet. 2018; 9: 552. https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2018.00552.
Bertsch E., Qiang W., Zhang Q., Espona-Fiedler M., Druschitz S., Liu Y. et al. MED12 and HMGA2 mutations: two independent genetic events in uterine leiomyoma and leiomyosarcoma. Mod. Pathol. 2014; 27(8): 1144-53.https://dx.doi.org/10.1038/modpathol.2013.243.
Wise L.A., Ruiz-Narvaez E.A., Palmer J.R., Cozier Y.C., Tandon A., Patterson N. et al. African ancestry and genetic risk for uterine leiomyomata. Am. J. Epidemiol. 2012; 176(12): 1159-68. https://dx.doi.org/10.1093/aje/kws276.
Edwards T.L., Michels K.A., Hartmann K.E., Velez Edwards D.R. BET1L and TNRC6B associate with uterine fibroid risk among European Americans. Hum. Genet. 2013; 132(8): 943-53. https://dx.doi.org/10.1007/s00439-013-1306-3.
Edwards T.L., Hartmann K.E., Velez Edwards D.R. Variants in BET1L and TNRC6B associate with increasing fibroid volume and fibroid type among European Americans. Hum. Genet. 2013; 132(12): 1361-9.https://dx.doi.org/10.1007/s00439-013-1340-1.
Liu B., Wang T., Jiang J., Li M., Ma W., Wu H., Zhou Q. Association of BET1L and TNRC6B with uterine leiomyoma risk and its relevant clinical features in Han Chinese population. Sci. Rep. 2018; 8(1): 7401.https://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-25792-z.
Lee S.C., Chou Y.H., Tantoh D.M., Hsu S.Y., Nfor O.N., Tyan Y.S., Liaw Y.P. Risk of uterine leiomyoma based on BET1L rs2280543 single nucleotide polymorphism and vegetarian diet. BMC Women's Health. 2022; 22(1): 139. https://dx.doi.org/10.1186/s12905-022-01721-1.

Поступила 18.04.2023

Принята в печать 30.06.2023

Алали Ола Мохамад, аспирант, Белгородский государственный национальный исследовательский университет, Белгород, Россия, alaliola9@gmail.com,
https://orcid.org/0000-0003-4370-6719
Чурносов Михаил Иванович, д.м.н., профессор, Белгородский государственный национальный исследовательский университет, Белгород, Россия, churnosov@bsu.edu.ru, https://orcid.org/0000-0003-1254-6134

Полногеномные исследования миомы матки

Алали О.М., Чурносов М.И.

Ключевые слова

Список литературы

Об авторах / Для корреспонденции

Также по теме