Оценка экспрессии микроРНК в очагах ретроцервикального эндометриоза
Цель исследования. Провести профилирование микроРНК в тканях эктопического и эутопического эндометрия, а также вывить сигнальные пути и процессы, регулируемые дифференциально экспрессирующимися микроРНК.Бобров М.Ю., Балашов И.С., Филиппова Е.С., Альмова И.К., Тимофеева А.В., Гусар В.А., Боровиков П.И., Хилькевич Е.Г., Чупрынин В.Д., Павлович С.В.
Материал и методы. Выявление дифференциально экспрессирующихся микроРНК проводили методом секвенирования нового поколения. Данные секвенирования валидировали методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Оценка сигнальных путей и процессов проводилась обогащением информационных баз данных методами биоинформационного анализа.
Результаты. По данным секвенирования было выявлено 429 мкРНК с разной представленностью в тканях эутопического и эктопического эндометрия. В результате статистической обработки данных на основании достоверности отличий и представленности во всех группах сравнения были отобраны 85 мкРНК для определения возможного участия их генов-мишеней во внутриклеточных каскадах и регулируемых ими процессах. Биоинформационный анализ показал вовлеченность регулируемых генов-мишеней в процессы пролиферации, миграции и инвазии, в ключевые каскады внутриклеточной сигнализации и воспалительные процессы.
Заключение. Полученные данные свидетельствуют о том, что изменение экспрессии микроРНК в тканях эктопического эндометрия и последующее нарушение регуляции экспрессии их генов-мишеней является важным патогенетическим звеном и может вносить существенный вклад в развитие эндометриоза.
Ключевые слова
микроРНК
эндометриоз
экспрессия генов-мишеней
секвенирование
полимеразная цепная реакция
Список литературы
1. Tosti C., Pinzauti S., Santulli P., Chapron C., Petraglia F. Pathogenetic mechanisms of deep infiltrating endometriosis. Reprod. Sci. 2015; 22(9): 1053-9.
2. Signorile P.G., Baldi A. New evidence in endometriosis. Int. J. Biochem. Cell Biol. 2015; 60: 19-22.
3. Harada T., ed. Endometriosis. Pathogenesis and treatment. Springer; 2014.
4. Fabian M.R., Sonenberg N., Filipowicz W. Regulation of mRNA translation and stability by microRNAs. Annu. Rev. Biochem. 2010; 79(1): 351-79.
5. Guo H., Ingolia N.T., Weissman J.S., Bartel D.P. Mammalian microRNAs predominantly act to decrease target mRNA levels. Nature. 2010; 466(7308): 835-40.
6. Lewis B.P., Shih I.H., Jones-Rhoades M.W., Bartel D.P., Burge C.B. Prediction of mammalian microRNA targets. Cell. 2003; 115(7): 787-98.
7. Bartel D.P. MicroRNAs: target recognition and regulatory functions. Cell. 2009; 136(2): 215-33.
8. Kloosterman W.P., Plasterk R.H.A. The diverse functions of microRNAs in animal development and disease. Dev. Cell. 2006; 11(4): 441-50.
9. Takasaki S. Roles of microRNAs in cancers and development. Methods Mol. Biol. 2015; 1218: 375-413.
10. Ohlsson Teague E.M., Van der Hoek K.H., Van der Hoek M.B., Perry N., Wagaarachchi P., Robertson S.A. et al. MicroRNA-regulated pathways associated with endometriosis. Mol. Endocrinol. 2009; 23(2): 265-75.
11. Filigheddu N., Gregnanin I., Porporato P.E., Surico D., Perego B., Galli L. et al. Differential expression of micrornas between eutopic and ectopic endometrium in ovarian endometriosis. J. Biomed. Biotechnol. 2010; 2010: 369549.
12. Braza-Boïls A., Marí-Alexandre J., Gilabert J., Sánchez-Izquierdo D., España F, Estellés A., Gilabert-Estellés J. MicroRNA expression profile in endometriosis: its relation to angiogenesis and fibrinolytic factors. Hum. Reprod. 2014; 29(5): 978-88.
13. Zhao M., Tang Q., Wu W., Xia Y., Chen D., Wang X. miR-20a contributes to endometriosis by regulating NTN4 expression. Mol. Biol. Rep. 2014; 41(9): 5793-7.
14. Zheng B., Xue X., Zhao Y., Chen J., Xu C.Y., Duan P. The differential expression of microRNA-143,145 in endometriosis. Iran. J. Reprod. Med. 2014; 12(8): 555-60.
15. Graham A., Falcone T., Nothnick W.B. The expression of microRNA-451 in human endometriotic lesions is inversely related to that of macrophage migration inhibitory factor (MIF) and regulates MIF expression and modulation of epithelial cell survival. Hum. Reprod. 2015; 30(3): 642-52.
16. Liu S., Gao S., Wang X.Y., Wang D.B. Expression of miR-126 and Crk in endometriosis: miR-126 may affect the progression of endometriosis by regulating Crk expression. Arch. Gynecol. Obstet. 2012;285(4): 1065-72.
17. Saare M., Rekker K., Laisk-Podar T., Sõritsa D., Roost A.M., Simm J. et al. High-throughput sequencing approach uncovers the miRNome of peritoneal endometriotic lesions and adjacent healthy tissues. PLoS One. 2014; 9(11): e112630.
18. Hawkins S.M., Creighton C.J., Han D.Y., Zariff A., Anderson M.L., Gunaratne P.H., Matzuk M.M. Functional microRNA involved in endometriosis. Mol. Endocrinol. 2011; 25(5): 821-32.
Поступила 06.04.2018
Принята в печать 20.04.2018
Об авторах / Для корреспонденции
Бобров Михаил Юрьевич, к.х.н., зав. лабораторией молекулярной патофизиологии ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова. Минздрава России.Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. Телефон: 8 (903) 251-86-77. E-mail: mbobr@mail.ru
Балашов Иван Сергеевич, младший научный сотрудник лаборатории биоинформатики ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова. Минздрава России.
Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. E-mail: i_balashov@oparina4.ru
Филлипова Елена Сергеевна, врач акушер-гинеколог гинекологического отделения ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России.
Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4
Альмова Индира Курманбиевна, аспирант хирургического отделения ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России.
Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. Телефон: 8 (905) 435-73-17. E-mail: www.gold11@mail.ru
Тимофеева Анжелика Владимировна, к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной патофизиологии ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова. Минздрава России. Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. E-mail: v_timofeeva@oparina4.ru
Гусар Владислава Анатольевна, к.м.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной патофизиологии ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова. Минздрава России. Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. E-mail: v_gusar@oparina4.ru
Боровиков Павел Игоревич, зав. лабораторией биоинформатики ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова. Минздрава России.
Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. E-mail: p_borovikov@oparina4.ru
Хилькевич Елена Григорьевна, д.м.н., врач акушер-гинеколог хирургического отделения ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России.
Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. Телефон: 8 (495) 438-77-83. E-mail: e_khilkevich@oparina4.ru. ORCID ID: 0000-0001-8826-8439
Чупрынин Владимир Дмитриевич, к.м.н., зав. хирургическим отделением ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России.
Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. Телефон: 8 (495) 438-35-75. E-mail:v_chuprynin@oparina4.ru
Павлович Станислав Владиславович, к.м.н., доцент, ученый секретарь ФГБУ НЦАГиП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России; профессор кафедры акушерства, гинекологии, перинатологии и репродукции ИПО ФГАОУ ВО Первый московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Минздрава России. Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. Телефон: 8 (495) 438-21-00. E-mail: st.pavlovich@mail.ru
Для цитирования: Бобров М.Ю., Балашов И.С., Филиппова Е.С., Альмова И.К., Тимофеева А.В., Гусар В.А., Боровиков П.И., Хилькевич Е.Г., Чупрынин В.Д., Павлович С.В. Оценка экспрессии микроРНК в очагах ретроцервикального эндометриоза. Акушерство и гинекология. 2018; 6: 55-61.
https://dx.doi.org/10.18565/aig.2018.6.55-61
Также по теме
