Особенности коагулазоотрицательных стафилококков, выделенных из центральных венозных катетеров новорожденных детей отдела реанимации и интенсивной терапии: формирование биопленок и популяционная структура по данным мультилокусного секвенирования
Корниенко М.А., Купцов Н.С., Городничев Р.Б., Малахова М.В., Любасовская Л.А., Гордеев А.Б., Никитина И.В., Смирнов Г.Б., Шитиков Е.А., Припутневич Т.В., Ильина Е.Н.
Цель исследования. Изучить способность госпитальной популяции S. epidermidis формировать биопленки на внутренней поверхности центральных венозных катетеров (ЦВК). Материал и методы. В ходе исследования была проанализирована коллекция 150 образцов ЦВК, полученных после катетеризации новорожденных детей. Результаты. Обнаружена колонизация условно-патогенными микроорганизмами 53 катетеров, на 50 образцах была бактериальная монокультура. Изоляты S. epidermidis встречались в 68% случаев и относились к 12 различным сиквенс-типам, причем преобладающим являлся ST59 (19 изолятов, 56%). У большинства изолятов не были детектированы гены icaABCD оперона, ответственного за синтез полисахарида PIA. Заключение. Большинство ЦВК было колонизировано S. epidermidis (62% изолятов), относящихся к сиквенс-типам, входящим в клональный комплекс СС2, что подтверждает их госпитальное происхождение. Была выявлена группа изолятов, обладающих повышенной способностью к адгезии на пластике. Отмечен ряд изолятов, не содержащих генов ica-оперона, но способных образовывать биопленку на поверхности катетеров по ica-независимому механизму.
Ключевые слова
Список литературы
1. Gahlot R., Nigam C., Kumar V., Yadav G., Anupurba S. Catheter-related bloodstream infections. Int. J. Crit. Illn. Inj. Sci. 2014; 4(2): 162-7.
2. Maki D.G., Kluger D.M., Crnich C.J. The risk of bloodstream infection in adults with different intravascular devices: a systematic review of 200 published prospective studies. Mayo. Clin. Proc. 2006; 81(9): 1159-71.
3. Otto M. Staphylococcus epidermidis – the “accidental” pathogen. Nat. Rev. Microbiol. 2009; 7(8): 555-67.
4. Seifert H., Cornely O., Seggewiss K., Decker M., Stefanik D., Wisplinghoff H. Bloodstream infection in neutropenic cancer patients related to short-term nontunnelled catheters determined by quantitative blood cultures, differential time to positivity, and molecular epidemiological typing with pulsed-field gel electrophoresis. J. Clin. Microbiol. 2003; 41(1): 118-23.
5. Donelli G., Vuotto C. Biofilm-based infections in long-term care facilities. Future Microbiol. 2014; 9(2): 175-88.
6. Flemming H.C., Wingender J., Szewzyk U., Steinberg P., Rice S.A., Kjelleberg S. Biofilms: an emergent form of bacterial life. Nat. Rev. Microbiol. 2016; 14(9):563-75.
7. Costerton J.W., Stewart P.S., Greenberg E.P. Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections. Science. 1999; 284(5418): 1318-22.
8. Fey P.D., Olson M.E. Current concepts in biofilm formation of Staphylococcus epidermidis. Future Microbiol. 2010; 5(6): 917-33.
9. Gerke C., Kraft A., Süssmuth R., Schweitzer O., Götz F. Characterization of the N-acetylglucosaminyl transferase activity involved in the biosynthesis of the Staphylococcus epidermidis polysaccharide intercellular adhesion. J. Biol. Chem. 1998; 273(29): 18586-93.
10. Patti J.M., Allen B.L., McGavin M.J., Höök M. MSCRAMM-mediated adherence of microorganisms to host tissues. Annu. Rev. Microbiol. 1994; 48: 585-617.
11. Любасовская Л.А., Припутневич Т.В., Никитина И.В., Корниенко М.А., Родченко Ю.В., Гордеев А.Б., Мелкумян А.Р., Зубков В.В., Ильина Е.Н., Дубоделов Д.В., Кондрахин А.П., Сафоновская А.А. Колонизация центрального венозного катетера у новорожденных ОРИТ: факторы риска и клиническая значимость. Акушерство и гинекология. 2016; 12: 114-20. http://dx.doi.org/10.18565/aig.2016.12.114-20
12. Miragaia M., Thomas J.C., Couto I., Enright M.C., de Lencastre H. Inferring a population structure for Staphylococcus epidermidis from multilocus sequence typing data. J. Bacteriol. 2007; 189(6): 2540-52.
13. Корниенко М.А., Ильина Е.Н., Боровская А.Д., Эдельштейн M.В., Сухорукова M.В., Кострцева М., Говорун В.М. Прямое бактериальное профилирование посредством MALDI масс-спектрометрии как метод быстрой классификации штаммов Staphylococcus aureus. Биомедицинская химия. 2012; 58(5): 501-13.
14. Arciola C.R., Baldassarri L., Montanaro L. Presence of icaA and icaD genes and slime production in a collection of staphylococcal strains from catheter-associated infections. J. Clin. Microbiol. 2001; 39(6): 2151-6.
15. Arciola C., Gamberini S., Campoccia D., Visai L., Speziale P., Baldassarri L., Montanaro L. A multiplex PCR method for the detection of all five individual genes of ica locus in Staphylococcus epidermidis. A survey on 400 clinical isolates from prosthesis-associated infections. J. Biomed. Mater. Res. A. 2005; 75(2): 408-13.
16. Корниенко М.А., Копыльцов В.Н., Шевлягина Н.В., Диденко Л.В., Любасовская Л.А., Припутневич Т.В., Ильина Е.Н. Способность стафилококков различных видов к образованию биопленок и их воздействие на клетки человека. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2016; 1: 18-25.
17. Christensen G.D., Simpson W.A., Younger J.J., Baddour L.M., Barrett F.F., Melton D.M., Beachey E.H. Adherence of coagulase-negative staphylococci to plastic tissue culture plates: a quantitative model for the adherence of staphylococci to medical devices. J. Clin. Microbiol. 1985; 22(6): 996-1006.
18. Polin R.A., Saiman L. Nosocomial infections in the Neonatal Intensive Care Unit. NeoReviews. 2003; 4(3): e81-9.
19. Figueiredo A., Ferreira F., Beltrame C., Côrtes M. The role of biofilms in persistent infections and factors involved in ica-independent biofilm development and gene regulation in Staphylococcus aureus. Crit. Rev. Microbiol. 2017; 43(5): 602-20.
Поступила 08.09.2017
Принята в печать 22.09.2017
Об авторах / Для корреспонденции
Корниенко Мария Андреевна, к.б.н., младший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов ФГБУ ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА. Адрес: 119435, Россия, Москва, Малая Пироговская, д. 1а. Телефон: 8 (903) 778-24-51. E-mail: kornienkomariya@gmail.comКупцов Никита Сергеевич, лаборант-исследователь лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов ФГБУ ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА.
Адрес: 119435, Россия, Москва, Малая Пироговская, д. 1а. Телефон: 8 (903) 778-24-51
Городничев Роман Борисович, младший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов ФГБУ ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА. Адрес: 119435, Россия, Москва, Малая Пироговская, д. 1а. Телефон: 8 (903) 778-24-51
Малахова Майя Владимировна, научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов ФГБУ ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА.
Адрес: 119435, Россия, Москва, Малая Пироговская, д. 1а. Телефон: 8 (903) 778-24-51
Любасовская Людмила Анатольевна, к.м.н., зав. отделением клинической фармакологии отдела микробиологии и клинической фармакологии ФГБУ НМИЦ АГП
им. академика В.И. Кулакова Минздрава России. Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. Телефон: 8 (906) 074-42-46. E-mail: labmik@yandex.ru
Гордеев Алексей Борисович, к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории микробиологии ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России.
Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. Телефон: 8 (916) 226-86-67. E-mail: gordeew@vega.protres.ru
Никитина Ирина Владимировна, к.м.н., старший научный сотрудник отделения реанимации и интенсивной терапии новорожденных отдела неонатологии и педиатрии ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России.
Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. Телефон: 8 (495) 438-22-71. E-mail: i_nikitina@oparina4.ru
Смирнов Георгий Борисович, член корреспондент РАН, д.б.н., профессор, главный научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов ФГБУ ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА. Адрес: 119435, Россия, Москва, Малая Пироговская, д. 1а. Телефон: 8 (903) 778-24-51
Шитиков Егор Александрович, к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной генетики микроорганизмов ФГБУ ФНКЦ
Физико-химической медицины ФМБА. Адрес: 119435, Россия, Москва, Малая Пироговская, д. 1а. Телефон: 8 (903) 778-24-51
Припутневич Татьяна Валерьевна, д.м.н., зав. отделом микробиологии и клинической фармакологии ФГБУ НМИЦ АГП им. академика В.И. Кулакова Минздрава России. Адрес: 117997, Россия, Москва, ул. Академика Опарина, д. 4. Телефон: 8 (910) 414-56-16. E-mail: priput1@gmail.com
Ильина Елена Николаевна, д.б.н., зам. директора по научной работе ФГБУ ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА.
Адрес: 119435, Россия, Москва, Малая Пироговская, д. 1а. Телефон: 8 (903) 778-24-51
Для цитирования: Корниенко М.А., Купцов Н.С., Городничев Р.Б., Малахова М.В., Любасовская Л.А., Гордеев А.Б., Никитина И.В., Смирнов Г.Б., Шитиков Е.А., Припутневич Т.В., Ильина Е.Н. Особенности коагулазоотрицательных стафилококков, выделенных из центральных венозных катетеров новорожденных детей отделения реанимации и интенсивной терапии: формирование биопленок и популяционная структура по данным мультилокусного секвенирования. Акушерство и гинекология. 2018; 5: 86-94.
https://dx.doi.org/10.18565/aig.2018.5.86-94